Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCP20941 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PDCP20941 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCP20941 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PDCP20941 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCP20941 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCP20941 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCP20941 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms