Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMNB1P20700 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMNB1P20700 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms