Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCNA2P20248 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCNA2P20248 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms