Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTPS1P17812 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTPS1P17812 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms