Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TOP1P11387 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP1P11387 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP1P11387 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP1P11387 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP1P11387 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP1P11387 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP1P11387 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TOP1P11387 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TOP1P11387 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TOP1P11387 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TOP1P11387 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TOP1P11387 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms