Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ITGAMP11215 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms