Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RARBP10826 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RARBP10826 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RARBP10826 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RARBP10826 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RARBP10826 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RARBP10826 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RARBP10826 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms