Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCL3P10147 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCL3P10147 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CCL3P10147 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCL3P10147 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms