Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PGA3P0DJD8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PGA3P0DJD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms