Protein–RNA interactions for Protein: P0CF51

TRGC1, T-cell receptor gamma chain C region 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGC1P0CF51 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRGC1P0CF51 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGC1P0CF51 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms