Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EGFRP00533 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EGFRP00533 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EGFRP00533 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EGFRP00533 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EGFRP00533 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
EGFRP00533 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EGFRP00533 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EGFRP00533 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EGFRP00533 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EGFRP00533 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms