Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NSD2O96028 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NSD2O96028 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NSD2O96028 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NSD2O96028 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NSD2O96028 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NSD2O96028 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NSD2O96028 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NSD2O96028 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NSD2O96028 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms