Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX58O95786 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX58O95786 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX58O95786 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX58O95786 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX58O95786 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX58O95786 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms