Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLSTN1O94985 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms