Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SOGA1O94964 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SOGA1O94964 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
SOGA1O94964 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SOGA1O94964 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SOGA1O94964 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SOGA1O94964 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SOGA1O94964 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SOGA1O94964 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SOGA1O94964 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SOGA1O94964 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SOGA1O94964 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SOGA1O94964 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SOGA1O94964 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SOGA1O94964 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms