Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM2O94769 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM2O94769 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM2O94769 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM2O94769 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM2O94769 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM2O94769 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM2O94769 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM2O94769 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM2O94769 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM2O94769 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM2O94769 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM2O94769 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM2O94769 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM2O94769 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ECM2O94769 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms