Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC45O75419 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC45O75419 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC45O75419 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC45O75419 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC45O75419 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC45O75419 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC45O75419 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC45O75419 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC45O75419 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC45O75419 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC45O75419 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms