Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB11FIP3O75154 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB11FIP3O75154 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms