Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIN3BO60391 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIN3BO60391 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms