Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB3O43889 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CREB3O43889 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CREB3O43889 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CREB3O43889 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CREB3O43889 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CREB3O43889 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms