Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYNGR2O43760 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR2O43760 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms