Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ACTN4O43707 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACTN4O43707 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms