Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF3O43395 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF3O43395 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms