Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSH5O43196 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC040934.1-201ENST00000523101 513 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSH5O43196 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSH5O43196 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSH5O43196 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSH5O43196 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSH5O43196 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSH5O43196 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSH5O43196 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MSH5O43196 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MSH5O43196 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MSH5O43196 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms