Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PLXNB1O43157 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms