Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBDO15205 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBDO15205 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBDO15205 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBDO15205 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms