Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SOCS3O14543 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SOCS3O14543 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SOCS3O14543 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOCS3O14543 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SOCS3O14543 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SOCS3O14543 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SOCS3O14543 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SOCS3O14543 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SOCS3O14543 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SOCS3O14543 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SOCS3O14543 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms