Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HIP1O00291 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HIP1O00291 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HIP1O00291 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HIP1O00291 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIP1O00291 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HIP1O00291 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HIP1O00291 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HIP1O00291 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms