Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DFFAO00273 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DFFAO00273 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DFFAO00273 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DFFAO00273 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DFFAO00273 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms