Protein–RNA interactions for Protein: O00192

ARVCF, Armadillo repeat protein deleted in velo-cardio-facial syndrome, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARVCFO00192 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARVCFO00192 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARVCFO00192 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms