Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms