Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SRRM5B3KS81 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SRRM5B3KS81 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms