Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SOBPA7XYQ1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SOBPA7XYQ1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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