Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SDR42E2A6NKP2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SDR42E2A6NKP2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms