Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CBY3A6NI87 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CBY3A6NI87 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms