Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NEMP2A6NFY4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NEMP2A6NFY4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms