Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GOLGA6BA6NDN3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GOLGA6BA6NDN3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms