Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00862A6NCI5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00862A6NCI5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms