Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MAP1LC3B2A6NCE7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MAP1LC3B2A6NCE7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms