Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VPS37CA5D8V6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VPS37CA5D8V6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms