Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FRMD3A2A2Y4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FRMD3A2A2Y4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms