Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC02511-201ENST00000505736 1668 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FGG-204ENST00000405164 1539 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR10D3-201ENST00000318666 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL390760.1-201ENST00000366188 410 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RPSAP59-201ENST00000421048 890 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL390866.1-201ENST00000425137 469 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00460-203ENST00000444865 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RPS2P25-201ENST00000467247 580 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL58P-201ENST00000473445 294 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01085-203ENST00000511195 326 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PDCD6IPP2-205ENST00000565892 498 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PPP4R1-AS1-201ENST00000582435 379 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL050343.1-203ENST00000586761 1290 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PPP3CB-AS1-214ENST00000620432 654 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CCNT1-206ENST00000640148 596 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ERICH3-202ENST00000420661 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 UIMC1-207ENST00000506128 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL049697.1-201ENST00000507897 2301 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CDY7P-201ENST00000429883 1604 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AQP4-AS1-202ENST00000578701 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FOLH1B-202ENST00000529567 2145 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL049844.3-201ENST00000454207 1496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL355488.1-201ENST00000449169 2611 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC106712.1-201ENST00000483840 1888 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FCAR-204ENST00000359272 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AF274855.1-201ENST00000411474 850 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 IFNA12P-201ENST00000413147 571 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AGKP1-201ENST00000455254 1263 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SEC11A-202ENST00000455959 1223 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC131233.1-201ENST00000479200 955 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC008417.1-201ENST00000510014 565 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SEC11A-209ENST00000560266 1089 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC021755.3-201ENST00000560376 864 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC023827.2-201ENST00000566880 1061 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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