Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 OXCT1-204ENST00000509987 1441 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ZHX3-218ENST00000560364 4283 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 OAZ3-211ENST00000639906 708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 TRIP12-203ENST00000389044 6405 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 MAPK10-392ENST00000642103 3126 ntAPPRIS P2 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 HDAC9-214ENST00000441542 3210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 UPF2-202ENST00000357604 5193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 COL11A1-201ENST00000353414 7173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 MAPKBP1-201ENST00000456763 7158 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 NPPA-AS1_1.1-201ENST00000622391 173 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RNF125-201ENST00000217740 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 EPM2AIP1-201ENST00000322716 8126 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 NLRP3-204ENST00000366497 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 GABPA-201ENST00000354828 5120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 RBM11-201ENST00000400577 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 GRIK2-202ENST00000358361 1981 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
XIRP2A4UGR9 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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