Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OR51H1-201ENST00000322059 999 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL355862.1-201ENST00000412705 353 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC009413.1-201ENST00000414823 399 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MED15P9-201ENST00000424716 533 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL731892.1-201ENST00000437364 1192 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL161646.1-201ENST00000447860 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ANAPC15-211ENST00000542531 812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC078929.1-201ENST00000547679 502 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CRADD-210ENST00000552033 622 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC044860.3-201ENST00000559957 368 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC124283.2-201ENST00000575085 318 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL390058.1-201ENST00000603834 629 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RPS28P1-201ENST00000604589 187 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL760P-201ENST00000607344 270 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PRSS3P3-201ENST00000612253 692 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL353753.1-201ENST00000612217 2320 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 NACAP1-201ENST00000419462 1555 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CLK1-215ENST00000621181 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SAMMSON-203ENST00000641005 2168 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 TTC39B-206ENST00000507285 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR1M1-202ENST00000641627 2535 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MEF2C-232ENST00000629612 2851 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PCNAP3-201ENST00000397222 778 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL773545.3-201ENST00000414297 706 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC231533.2-201ENST00000419045 978 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL390840.1-201ENST00000420303 988 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC013429.1-201ENST00000456604 422 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC006070.1-201ENST00000508151 193 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LACTB2-AS1-204ENST00000519167 793 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR4A1P-201ENST00000532342 920 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 DNM1P47-201ENST00000560757 334 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AP003071.2-201ENST00000562772 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC130456.5-201ENST00000569345 510 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC005899.3-201ENST00000580360 271 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 OR7E94P-202ENST00000601375 790 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AL583859.2-202ENST00000602311 505 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 LINC02019-202ENST00000609204 845 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTL8BQ17RB0 AC243830.3-201ENST00000616810 376 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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