Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 HDAC9-218ENST00000456174 2307 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PPFIA2-202ENST00000407050 3903 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ENAH-204ENST00000366844 13168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PPP1R2P6-201ENST00000478565 588 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC109588.1-201ENST00000507759 726 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 COQ10B-202ENST00000409010 1355 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ARG1-202ENST00000356962 1468 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SLC10A7-201ENST00000335472 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MRPS17P1-201ENST00000596009 3130 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC010148.1-201ENST00000427619 707 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AP005202.1-201ENST00000489915 867 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC022126.1-201ENST00000502995 593 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 BCL2L13-203ENST00000355028 4458 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 BEST3-205ENST00000488961 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MAPK10-347ENST00000641762 2856 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TRPM8-204ENST00000433712 5291 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TNFAIP8-206ENST00000504771 8681 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CTNNA2-209ENST00000466387 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 IGHV4-59-201ENST00000390629 495 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL512649.2-201ENST00000446206 597 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC01706-201ENST00000455299 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 PCDH19-203ENST00000420881 7936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 NPIPB5-209ENST00000517539 3569 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 INSR-202ENST00000341500 8954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 EXOC7P1-201ENST00000509881 2059 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ERAP1-202ENST00000443439 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 OR2AH1P-202ENST00000641232 2744 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 KAT14-202ENST00000435364 3618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 NVL-211ENST00000469075 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
POLR2AP24928 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms