Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC011008.2-201ENST00000624866 3352 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FCGR1B-210ENST00000623603 1581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 DDX50P1-201ENST00000438163 2400 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 GNG13-201ENST00000248150 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OR4D1-201ENST00000268912 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SNORA73B-201ENST00000363217 204 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL137058.2-203ENST00000398039 825 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RPL5P27-201ENST00000437011 881 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC023886.1-201ENST00000506057 685 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC103409.1-201ENST00000521199 564 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SMCO2-203ENST00000535986 1096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC023908.2-201ENST00000558616 318 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC02180-201ENST00000566439 1010 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL355333.1-201ENST00000605632 279 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FAM74A6-203ENST00000615956 481 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC063952.4-201ENST00000634744 825 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CD163-209ENST00000541972 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AKT3-202ENST00000336199 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PRLR-219ENST00000619676 1402 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 GPR19-201ENST00000332427 1743 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AKR1C4-201ENST00000263126 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 INSL5-201ENST00000304526 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC068389.3-201ENST00000373384 529 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 IGHV4-34-201ENST00000390616 400 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RN7SKP225-201ENST00000410405 352 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC02257-201ENST00000412445 605 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RBM22P7-201ENST00000421321 280 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC004870.2-202ENST00000423781 706 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FDPSP1-201ENST00000424976 1071 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC092066.1-201ENST00000425131 317 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AL591846.2-201ENST00000425161 358 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 RPL6P2-201ENST00000425480 783 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 FGF12-AS3-201ENST00000452848 291 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 PSPC1P2-201ENST00000455130 225 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC107956.2-201ENST00000496042 454 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC139272.1-201ENST00000505516 640 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RTL8BQ17RB0 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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