Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RPL12P38-202ENST00000588627 2319 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SCML2-202ENST00000398048 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PTPRB-204ENST00000538708 5839 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 LINC01427-204ENST00000635299 1978 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 CHL1-AS1-201ENST00000417612 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC093627.1-201ENST00000465755 877 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SYNPR-208ENST00000472899 527 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SPRY1-201ENST00000339241 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 CYB5R4-202ENST00000369681 9252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 CRISPLD1-202ENST00000517786 1964 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SLC6A4-201ENST00000261707 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 CEP350-202ENST00000367607 13491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 SIGLECL1-205ENST00000597824 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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PTPRMP28827 AC090198.1-201ENST00000518639 2355 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 ANKRD27-201ENST00000306065 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 NOTCH2NL-203ENST00000578207 5042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
PTPRMP28827 RASSF2-202ENST00000379400 5427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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