Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TTC21B-AS1-202ENST00000443032 544 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL136982.6-201ENST00000444180 1238 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC017002.3-201ENST00000455309 757 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL590648.1-201ENST00000456479 460 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPS6P25-201ENST00000464444 748 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PHYKPL-205ENST00000476170 824 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RN7SL864P-201ENST00000493457 285 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PFN2-213ENST00000494827 793 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC00499-203ENST00000510736 587 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC083906.4-201ENST00000514634 987 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OPRK1-204ENST00000524278 1195 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC090707.1-201ENST00000528795 396 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LRP1-AS-201ENST00000554476 325 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL132855.1-201ENST00000557368 207 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CYB5B-205ENST00000561792 823 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC022165.1-201ENST00000568771 596 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC068014.1-201ENST00000576836 413 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PRR13P4-201ENST00000577786 421 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC009950.1-209ENST00000595586 777 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC008737.3-201ENST00000601661 221 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC008738.6-201ENST00000604605 569 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC239809.3-218ENST00000616018 1023 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL359834.1-201ENST00000635660 638 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MYO1B-201ENST00000304164 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OSBPL9-202ENST00000371714 3352 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CTPS1-201ENST00000372616 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AURKA-201ENST00000312783 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GRIK1-202ENST00000389124 2712 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DCLRE1C-206ENST00000378254 2485 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CLSTN2-AS1-201ENST00000513309 2693 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PLCE1-AS2-202ENST00000432782 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC022150.4-201ENST00000598322 2848 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNF14-203ENST00000394514 2905 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AP2B1-217ENST00000618940 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 OR1J4-201ENST00000340750 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RNA5SP256-201ENST00000390978 113 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 RCAN3-203ENST00000412742 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AP001042.1-201ENST00000416842 487 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 AL607028.1-201ENST00000433455 794 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 TAAR9-201ENST00000434551 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PDCD1Q15116 STARD13-IT1-201ENST00000456087 452 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms