Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 HMGB3P1-201ENST00000393368 573 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AAMDC-202ENST00000393427 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL138828.1-207ENST00000417643 734 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 EEF1A1P34-201ENST00000419888 1267 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC130472.1-201ENST00000427885 309 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LINC01852-201ENST00000434223 967 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MRPS21P1-201ENST00000453850 223 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 GCSAM-202ENST00000460387 623 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC007849.1-201ENST00000469794 513 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RN7SL223P-201ENST00000470401 294 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC021491.1-201ENST00000502300 349 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC095059.2-201ENST00000510601 933 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 IGLV10-67-201ENST00000519446 325 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC009869.1-201ENST00000530418 528 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 C11orf70-205ENST00000534360 520 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 MS4A12-205ENST00000537076 1019 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 DNM1P31-201ENST00000564149 696 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC092133.1-201ENST00000565828 719 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC092368.2-201ENST00000565911 600 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 C10orf82-203ENST00000588184 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC103724.4-201ENST00000605981 292 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RN7SL680P-201ENST00000620379 299 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC005383.1-201ENST00000622689 534 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 R3HCC1L-206ENST00000613938 1397 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PDK4Q16654 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PDK4Q16654 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PDK4Q16654 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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PDK4Q16654 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PDK4Q16654 C7orf73-202ENST00000507606 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PDK4Q16654 PRAC1-201ENST00000290294 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PDK4Q16654 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PDK4Q16654 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 LRRC75A-AS1-220ENST00000579473 585 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC010615.2-205ENST00000599993 929 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC004852.1-201ENST00000605206 154 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 RN7SL820P-201ENST00000616437 299 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CCL14-202ENST00000618404 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 GAS2-210ENST00000630668 674 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 AL021396.1-202ENST00000457707 1929 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SMAD5-AS1-201ENST00000297163 1816 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CCNC-204ENST00000482541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 KARSP2-201ENST00000415696 1639 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PDK4Q16654 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
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