Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC007126.1-201ENST00000508202 4781 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ZNF250-201ENST00000292579 6364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 PRKCQ-204ENST00000610727 3077 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 SYNJ1-211ENST00000630077 6898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 TACC2-202ENST00000334433 9377 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 OR4D9-202ENST00000641278 6063 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 IL5RA-203ENST00000383846 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 AC004988.1-201ENST00000415237 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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PTPRMP28827 EGFLAM-AS4-201ENST00000512496 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 AC006269.1-201ENST00000636752 2789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 RIOK2-201ENST00000283109 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 ADGRG6-203ENST00000367608 6879 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 FOXP2-201ENST00000350908 2638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PTPRMP28827 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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